一、流放囚禁
1917年3月8日，俄国爆发“二月革命”，尼古拉二世已经无法掌控形势，他被迫在3月15日深夜签署退位宣言。与此同时，资产阶级临时政府成立，统治俄国三百多年的罗曼诺夫王朝走向覆灭。最初的时候，临时政府想把沙皇一家流放到英国，但引起了民众的强烈反对。不久，皇后亚历山德拉、尼古拉二世先后被拘禁，不过环境相对宽松。
到了5月的时候，水兵们提出将沙皇全家交到彼得保罗要塞关押，临时政府为了保护沙皇一家的安全，决定将他们转移到乌拉尔的托博尔斯克。起初的时候，他们一家的生活条件还是相当舒适的，因为临时政府的克伦斯基克伦斯基曾经说过他不愿意做“俄国革命的马拉”，他还指示当地官员，“不要忘记这以前是沙皇，他本人和家庭不应受到任何怠慢”。
二、风雨欲来
十月革命后，临时政府垮台，革命的风潮很快就烧到了托博尔斯克。1918年1月，当地的士兵苏维埃解除了看守沙皇的两位官员，新的负责人又接到了通知，尼古拉一家必须“按照士兵的标准供应”。与此同时，苏俄当局面临着严重的危机，这时候《真理报》发表了一篇文章，提出“必须将他（指尼古拉二世）关进监狱并立即进行审判”。
1918年4月，斯维尔德洛夫做出指示，“把尼古拉活着押送到叶卡捷琳堡”，于是沙皇一家被转移到了叶卡捷琳堡，成为名副其实的囚徒。此时，苏俄高层已经考虑如何处置尼古拉二世的问题了。托洛茨基认为应该公开审判尼古拉二世，还要通过电台向全国转播，列宁也赞同托洛茨基的想法，但他担心时间不够用，所以暂时搁置了下来。
三、谁的命令
1918年6月，白卫军在西伯利亚地区成立了临时政府，战火即将烧到叶卡捷琳堡。于是，乌拉尔苏维埃做出决定，将尼古拉二世一家枪决，于是就有了7月16日深夜的这场灭门惨案。第二天凌晨两点，列宁收到了乌拉尔苏维埃的电报，尼古拉二世“根据乌拉尔地区苏维埃主席的法令已经处决，他的家人已被转移到一个安全的地点”。
表面上看，乌拉尔苏维埃的负责人别洛博罗多夫是“先斩后奏”的，但其实他的背后还有人！托洛茨基在他的书中写道，“杀死沙皇是斯大林的主意”，他担心沙皇引起白卫军的注意。7月12日，斯大林与斯维尔德洛夫商量好了，他说道：“在任何情况下都不能让沙皇落到白卫军的手里”。1998年，俄罗斯当局为沙皇一家举行了盛大的葬礼。